Philippe Bonifay, né dans le milieu du spectacle, d'un père artiste lyrique à l'Opéra de Paris, écrit d'abord pour le théâtre avant de se lancer dans le scénario. Il signe chez Glénat, avec Christian Rossi, Le Chariot de Thespis, avec Fontaine Les Ados du béton et avec Terpant Le Passage de la saison morte. Puis, chez Dupuis Aire-Libre  ZOO avec Frank, Messara avec Terpant chez Dargaud, éditeur chez lequel il lance La Compagnie des glaces. Chez Casterman il est l'auteur de Jane avec Falque, de Pirates avec son vieux complice Terpant, La Trilogie noire  avec Daoudi et Mon voisin le père Noël avec Béatrice Tillier. Chez Bamboo il crée Les Oubliés, avec Anne Boinnet et Juliette Derenne au dessin pour MEDAIR, une ONG Suisse qui menait alors une action humanitaire dans le cadre de ce drame des enfants soldats. Il a également écrit le scénario du Facteur Cheval avec Grycan et Mandrin avec Lacaf au dessin.

Auteur ou co-auteur d'une cinquantaine d'albums en 30 ans de carrière, il ne met pas l'accent sur la quantité mais sur le plaisir d'écrire. Il alterne l'écriture de scénarios avec la création de spectacles ou l'enseignement de « l'écriture scénaristique de BD et de cinéma ». 

Outre sa participation au projet Destins de Frank Giroud (Family van avec Loïc Malnati), il lance Origines chez Glénat, une nouvelle série de one-shots ayant pour thème les histoires "vraies" qui ont inspiré les contes. Parmi les premiers dessinateurs on peut citer Stéphane Duval pour Barbe-Bleue, avec lequel il signe aussi Gitans des mers chez Dupuis, Fabrice Meddour pour Blanche-Neige ou Terry Dodson, le dessinateur américain, actuelle vedette du Marvel, qui fait des essais pour un nouveau sujet.

Philippe Bonifay vit actuellement à Cayenne, en Guyane. Il aime errer seul au milieu de la forêt amazonienne et dormir dans son hamac, réveillé plus que bercé par le cri des singes hurleurs.