L'Académie Alphonse Allais a été créée en 1954 à l'initiative d'Henri Jeanson à l'occasion du mémorable centenaire de la naissance du grand Alphi, à Honfleur, et consolidée en 1985 par Robert Chouard et Robert Rotrou – leurs prédécesseurs, peu enclins aux formalités administratives (ce qu'Alphonse Allais aurait certainement apprécié) ayant oublié d'en enregistrer la fondation.
Entre autres activités, l'Académie décerne le prix Alphonse Allais et intronise les académiciens dont les candidatures sont retenues par la grande chancellerie. Les lauréats reçoivent la très convoitée Comète de Allais. Le premier prix Alphonse Allais a été décerné à Eugène Ionesco; le prix 2013 à Jean-Pierre Mocky. L'Académie Alphonse Allais (A3) est administrée par la grande chancellerie, seule habilitée à recevoir les candidatures des futurs sociétaires et à procéder à leur intronisation.