Docteur en Droit de l'Université catholique de Louvain, Charles Jaumotte a tout d'abord été chercheur boursier du gouvernement français à l'Institut National de la Recherche Agronomique à Rennes, chercheur au Centre de Recherches Universitaires de Namur et détaché à la CECA à Luxembourg pour y développer les prévisions trimestrielles de consommation de produits sidérurgiques. Il a été ensuite Fellow du British Council à l'Université de Bristol. Docteur en Sciences économiques des Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix à Namur, il fut, dès 1971, professeur ordinaire dans cette université où il a enseigné, outre le cours de « Faits et mécanismes économiques » en première candidature, les cours de « Finances publiques » et de « Politique économique » en maîtrise. Il a été, par ailleurs, administrateur délégué de l'université de 1973 à 2002. Il a également dirigé de nombreuses équipes de recherche dans les domaines de l'économie régionale, de la gestion du secteur non marchand et de l'économie circulaire publiant de multiples résultats.